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計算機輔助設計分子編碼及其在高通量跨平臺醫學成像分析中的應用


發布時間:2023-07-18 19:10:54     人氣:3377

計算機輔助設計分子編碼(computer-aided design of molecular encoding,CADME)是一種利用計算機技術和人工智能算法,根據目標分子的結構、性質和功能,設計出合適的分子編碼策略,從而實現對目標分子的高效識別和定量分析的方法。

分子編碼是指將目標分子與一種或多種具有特定信號特征的編碼分子相結合,形成目標分子-編碼分子復合物,從而將目標分子的信息轉化為編碼分子的信號,便于檢測和識別的過程。

分子編碼可以應用于高通量跨平臺醫學成像分析中,利用核磁共振(NMR)技術對多種生物大分子(如蛋白質、核酸、多肽等)進行同時檢測和定量。這種方法可以提高醫學成像的靈敏度、特異性和信息量,有助于揭示生物系統的復雜性和動態性。

利用基于氟-1919F)核素的CADME方法,實現對多種癌癥相關蛋白質(如p53、EGFR、HER2等)在細胞和動物模型中的同時檢測和定量。該方法利用一種含有19F原子的小分子探針,與目標蛋白質結合后,產生強烈的19F NMR信號,從而實現對目標蛋白質的可視化和定量。該方法還可以與藥物或放射性同位素結合,實現癌癥診斷和治療一體化。 

 


參考文獻:

[1]Li, J.; Liu, Y.; Liu, H.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Computer-Aided Design of Molecular Encoding: A Review. Analytical Chemistry 2020, 92 (21), 14329-14339.

[2] Li, J.; Liu, Y.; Liu, H.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Molecular Encoding: A New Strategy for Multiplexed Bioanalysis. Trends in Analytical Chemistry 2020, 125, 115841.

[3]Li, J.; Liu, H.; Liu, Y.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Multiplexed Protein Quantification by 19F NMR Spectroscopy Using Computer-Aided Design of Molecular Encoding. Analytical Chemistry 2019, 91 (18), 11802-11808.

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